4月 30, 2024

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捕食者の糞中のDNAからヨーロッパケナガサイの遺伝子を再構成:ScienceAlert

捕食者の糞中のDNAからヨーロッパケナガサイの遺伝子を再構成:ScienceAlert

私たちは古代の DNA の驚くほど豊富な情報源を無視しているかもしれません。

科学者たちは、絶滅したケナガサイのミトコンドリアゲノムを再構築することに成功しました。アンティーク コロドンタ) – ホラアナハイエナの化石化した糞便から抽出された DNA より (クロクタ クロコッタ スピリア)で夕食をとりました。

これは、ヨーロッパでケナガサイについて発見された最初のゲノムです。 この種に関するこれまでのゲノムデータはすべてシベリアの動物から得られたものです。 おそらくこれは、サイの群れ間の地域的な違いについての手がかりを与える可能性がありますが、同時に化石化した糞便や コプロライト、貴重なリソースになる可能性があります。

「ここで作製されたマイトゲノムアセンブリは、ヨーロッパケナガサイの最初のマイトゲノム記録であり、したがって、この象徴的な更新世の巨大動物相の物理的地理学を解明するのに役立つ重要な資料です。」 研究者たちは論文に次のように書いています

「別の種の糞石から比較的簡単に回収できたという事実(つまり、ケナガサイに直接関係する遺骨は必要なかった)は、幅広い物質からゲノムデータを取得することの価値を強調しています。」

実際、糞石は歴史的な金鉱山に変わりました。 保存された糞便から、過去の時代に人や動物が何を食べていたかを知り、どのような寄生虫に感染したかを調べ、さらには人間の腸内微生物叢の変化を研究することもできます。

ドイツのコンスタンツ大学の分子生物学者ピーター・アンドレアス・シーバー率いるチームは、化石化したハイエナの糞を研究しました。 中期旧石器時代 現在のドイツにあたる地域で、約30万年前から3万年前まで続いた時代。

この糞石は発掘され、その中に眠っていました 博物館のコレクション、 のように 多くの糞便主義者が現在そうしています。 昨年発表された論文 それを確認します 博物館のコレクションにある糞石は、地球の生物学史の研究において無視され、未開発の資源です。

シーバーと彼の同僚は、特別なツールを使用して糞石の中から物質を抽出し、読み出し用の DNA を準備し、結果を DNA シーケンサーで実行しました。

DNAが分解されてしまったのです。 しかし、研究者らはホラアナハイエナとケナガサイの両方から遺伝物質を回収し、それを現代および古代の他のゲノムと比較することに成功した。

サイの DNA は 1 つのサンプルからしか得られませんでしたが、この DNA は研究者にこの種とユーラシア大陸全体にわたるその多様性について何か新しいことを伝えることができました。

ケナガサイの骨格。 (ディディエ・デスキン / ウィキメディア・コモンズ / CC BY-SA 4.0)

実際、最終的にハイエナの餌となったヨーロッパのサイとシベリアのサイの間には、この 2 つのグループが少し前に多様化し始めたことを示唆するほどの十分な違いがあった。 ヨーロッパのサイは、250万年から15万年前のある時点で分裂を始めました。

これは、サイが更新世後期、少なくともこのサイが属する崩壊期に西ヨーロッパへ繰り返し生息域拡大を行ったという仮説に真っ向から反するものである。

雄大な古代サイの DNA をさらに回収して分析できれば、たとえ糞便ほど雄大ではないものから DNA を回収しなければならなかったとしても、その歴史をさらに明らかにするのに役立つだろう。

今回のサンプルも同様です。 研究者たちは書いています「以前の発掘で回収され、コレクションに保管されている遺物の多くは、これまでほとんど無視されてきた古代の DNA 源です。」

この研究は、 生物学の手紙

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